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2号染色体开放阅读框抗体的应用

发布日期:2020/3/19 16:44:01

背景[1-3]

2号染色体开放阅读框抗体是可以特异性结合2号染色体开放阅读框先关蛋白的一种单克隆免疫蛋白。2号染色体是人类的23对染色体之一。在正常的人类体细胞中,会有1对2号染色体。这条染色体是人类所拥有的第二大染色体,拥有2.37亿个碱基对,其占有的DNA大小,大约是细胞中DNA总数的8%。2号染色体所拥有的基因数目并不确定,遗传学研究估计大约有1888个基因。重要的发育调控基因之一HOXD homeobox基因丛集(gene cluster)位在这条染色体上。

在分子生物学中,开放阅读框(Open Reading Frame,ORF)从起始密码子开始,是DNA序列中具有编码蛋白质潜能的序列,结束于终止密码子连续的碱基序列。由于密码子(codon)读写起始位点的不同,DNA序列可能按六种ORF阅读和翻译(每条链三种,对应三种不同的起始位点)。ORF识别则是确定哪种开放阅读框对应真正的多肽编码序列的过程。开放阅读框[open reading frame,ORF]是结构基因的正常核苷酸序列,从起始密码子到终止密码子的阅读框可编码完整的多肽链,其间不存在使翻译中断的终止密码子。在mRNA序列中,每三个连续碱基(即三联“密码子”)编码相应的氨基酸。其中有一个起始密码子AUG和三个终止密码子UAA,UAG,UGA。核糖体从起始密码子开始翻译,沿着mRNA序列合成多肽链并不断延伸,遇到终止密码子时,多肽链的延伸反应终止。由于读写位置不同,ORF在两条链上具有六种可能性。

应用[4][5]

用于急性白血病患者2号染色体错配修复基因连锁微卫星不稳定性研究

急性白血病患者2号染色体错配修复基因连锁微卫星的不稳定性改变,以推断错配修复基因突变、缺失变化对于急性白血病发生、发展过程中的作用与意义。方法选取急性白血病患者骨髓及口腔黏膜细胞标本各53例,其中急性粒细胞白血病(AML)33例,急性淋巴细胞白血病(ALL)20例,另外收集慢性粒细胞白血病(CML)标本5例,骨髓异常增生综合征(MDS)3例。选取2号染色体上两个错配修复基因(hMSH2、hPMS1)连锁的四个微卫星位点(D2s123、D2s119、D2s117、D2s115)进行多重PCR扩增,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳/银染,观察微卫星不稳定性(microsatellite instability,MSI)及杂合性缺失(loss of heterozygocyte,LOH)发生情况,并进行分析。结果53例急性白血病患者中,MSI的检出率为69.8%(37/53),共78例次。hMSH2附近的D2s123,D2s119位点分别有16例/22例发生MSI,发生率约为30.2%/41.5%;其中LOH的发生率分别为9.4%(5/53),7.5%(4/53)。

与hPMS1基因连锁的D2s117和D2s115两个位点,MSI的检出率为33.9%(18/53),39.6%(21/53);其中LOH则分别有7.5%(4/53)和9.4%(5/53)为阳性。四位点中D2s119位点的不稳定性表达率最高,AML患者中MSI发生率为36.4%(12/33),ALL患者为30%(6/20)。此4位点在AML,ALL中的表达的差别均无统计学意义(查表法)。有2处或2处以上发生MSI(RER+)的有28例。4例初发CML均未检到微卫星异常改变,而1例加速期CML出现了3个位点的MSI。另一例MDS(RAEB-T)检出2位点的不稳定性变化。讨论急性白血病患者2号染色体上两个错配修复基因连锁微卫星均可检测到高频率的MSI和LOH,说明此错配修复基因的突变与急性白血病的发生、发展有关。多个位点的MSI现象说明急性白血病的发生是一个多部位、多步骤染色体突变累积的结果。

参考文献

[1]Deficiency of the ATM protein expression defines and aggressive subgroup of B-cell chronin lymphocytic leukemia.Starostik P,Mansgouri T,O’BrienS,et al.Cancer Research.1998

[2]Detection of heteroduplex DNA molecules among the products of Sacchromytes cerevisiae meiosis.Lichten M,Goldon AC.Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America.1990

[3]Instability of short tandem repeats(microsatellite)in human cancer.Wooster R,Cleton-Jansen AM,Collins N,et al.Nature Genetics.1994

[4]Comprehensive alletotyping of human renal cell carcinomas using microsatellite DNA probes.Thrash-Bingham CA,Salazar H,Freed JJ,et al.Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America.1995

[5]任志华.急性白血病患者2号染色体错配修复基因连锁微卫星不稳定性研究[D].青岛大学,2003.

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