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海藻百伯史坦菌PCR试剂盒的应用

发布日期:2024/1/11 8:39:36

背景[1-3]

海藻百伯史坦菌PCR试剂盒是一种用于检测海藻百伯史坦菌的实验工具,采用聚合酶链式反应(PCR)技术进行检测。该试剂盒具有高灵敏度和特异性,能够快速、准确地检测出海藻百伯史坦菌,对于该病的诊断和治疗具有重要意义。

海藻百伯史坦菌是一种常见的病原菌,可引起人类和动物感染,导致多种疾病。该菌在自然界中广泛存在,可通过直接接触或污染的食物、水源等途径传播。感染海藻百伯史坦菌后,患者可能出现发热、咳嗽、腹泻等症状,严重时可能导致死亡。因此,对海藻百伯史坦菌进行快速、准确的检测对于控制该病的传播和预防具有重要意义。

海藻百伯史坦菌PCR试剂盒的组成通常包括一对引物、Taq DNA聚合酶、dNTPs等必要的PCR反应成分,以及可能包含的各种成分如染料、缓冲液、特异性结合探针等。引物是PCR反应的关键成分,它们与海藻百伯史坦菌基因的特定区域结合,从而启动DNA的扩增过程。Taq DNA聚合酶是一种耐热的DNA聚合酶,能够催化DNA的合成。dNTPs是合成DNA的基本原料。

使用海藻百伯史坦菌PCR试剂盒进行检测时,首先需要采集感染海藻百伯史坦菌的样本,如患者的分泌物、排泄物、血液等。将样本中的DNA与试剂盒中的引物和Taq DNA聚合酶等成分混合,进行PCR反应。反应过程中,DNA会不断扩增,最终形成大量的特定基因片段。通过凝胶电泳等技术对这些片段进行分析,可以判断出是否存在海藻百伯史坦菌基因,从而确定患者是否感染该病原体。

海藻百伯史坦菌PCR试剂盒.png

海藻百伯史坦菌PCR试剂盒

海藻百伯史坦菌PCR试剂盒的操作步骤如下:

1.样本采集:从患者体内采集血液、粪便、组织等样本,并将其保存在无菌容器中。

2.DNA提取:将采集到的样本进行DNA提取,通常采用柱式或磁珠式DNA提取试剂盒。提取后的DNA应保存在-20°C或更低的温度下。

3.PCR反应体系准备:根据海藻百伯史坦菌PCR试剂盒的要求,配制PCR反应体系,包括引物、荧光探针、dNTPs、DNA聚合酶等。

4.PCR反应:将提取的DNA加入到PCR反应体系中,进行PCR反应。反应条件和时间根据试剂盒说明书的要求进行设置。

5.结果分析:将PCR反应后的产物进行荧光信号检测,根据荧光信号的出现情况判断是否存在海藻百伯史坦菌的感染。

应用[4-5]

海藻百伯史坦菌PCR试剂盒可以用于榆林市湖羊呼吸道病原菌流行病学调查及耐药基因检测

对榆林各县区规模化湖羊场细菌性呼吸道疾病进行流行病学调查,对不同生长阶段羊呼吸道细菌群落结构及耐药性基因分布进行了初步研究,为当地湖羊呼吸道疾病的防治提供思路和参考。

主要研究内容及结果如下:1、在榆林市11个县区的20个规模化湖羊场,随机采集2096只羊的鼻拭子,进行海藻百伯史坦菌PCR试剂盒PCR检测。发现大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、多杀性巴氏杆菌、肺炎克雷伯菌、溶血性曼氏杆菌的阳性率分别为12.36%、3.72%、31.63%、14.69%、23.61%。北五县区(榆阳区、定边县、靖边县、神木市、府谷县)湖羊呼吸道病原菌的总阳性率高于南六县(佳县、米脂县、绥德县、子洲县、吴堡县、清涧县);万只以上规模场中病原菌阳性率最高,1000只~10000只规模场次之、1000只以下规模最低。

2、在榆林市某万只以上规模的舍饲湖羊场中,采集3日龄、7日龄、21日龄、60日龄、妊娠母羊、后备育肥羊鼻拭子,提取DNA、海藻百伯史坦菌PCR试剂盒扩增样品中细菌16S基因的V3-V4(a)可变区,通过Illumina Novaseq 6000 PE250平台测序及生物信息学分析。

海藻百伯史坦菌PCR试剂盒结果显示:(1)物种组成方面,一共检测出25个门、54个纲、97个目、206个科、513个属、700个种。变形菌门、厚壁菌门、拟杆菌门、软壁菌门、放线菌门、梭杆菌门为主要的优势菌门。3日龄组中物种丰富度和多样性比较高,7日龄、21日龄大量下降,60日龄下降到最低,妊娠母羊组中丰富度和多样性出现增长、后备育肥羊组中最高。

参考文献

[1]Suttonella ornithocola detected within lesions of tit birds(Paridae)from epidemic death episodes in Germany,2018–2020[J].Leitzen Eva;Peters Martin;Merbach Sabine;Wohlsein Peter;Baumgärtner Wolfgang.Frontiers in Veterinary Science,2022

[2]Shifts of Antibiotic Resistomes in Soil Following Amendments of Antibiotics-Contained Dairy Manure[J].Kang Jijun;Liu Yiming;Chen Xiaojie;Xu Fei;Xiong Wenguang;Li Xiubo.International Journal of Environmental Research and Public Health,2022

[3]Surveillance Study of Klebsiella pneumoniae in the Giant Panda Revealed High Genetic Diversity and Antibiotic Therapy Challenge[J].Feng Yang;Chen Yaoyan;Liu Songrui;Hou Rong;Yan Xia;Geng Yi;Zhong Zhijun;Guo Hongrui;Ouyang Ping;Zhang Dongsheng;Su Xiaoyan.Antibiotics,2022

[4]Antimicrobial resistance pattern of methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolated from sheep and humans in Veterinary Hospital Maiduguri,Nigeria.[J].Jauro Solomon;Hamman Mark M;Malgwi Kefas D;Musa Jasini A;Ngoshe Yusuf B;Gulani Isa A;Kwoji Iliya D;Iliya Ibrahim;Abubakar Mustapha B;Fasina Folorunso O.Veterinary world,2022

[5]李娟.榆林市湖羊呼吸道病原菌流行病学调查及耐药基因检测[D].榆林学院,2023.

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